Pri činnostiach zakázaných v chránených územiach (výstavba, ťažba dreva, terénne úpravy, chemické ošetrenie) môže príslušný orgán ochrany prírody udeliť výnimku — individuálny súhlas. Bez tohto súhlasu nie je možné vydať stavebné povolenie ani realizovať zakázanú činnosť. Orgánom sú krajský úrad životného prostredia alebo Štátna ochrana prírody.
§ Zákon č. 543/2002 Z.z. – o ochrane prírody a krajiny, § 58